Projektstatus: abgeschlossen

Neue Erkenntnisse über die Zusammensetzung der Darm-Mikrobiota in Mensch und Tier lassen eine bedeutsame Rolle von Dysbalancen bei der Krankheitsentwicklung erahnen. NeoBIOM bündelte zentrale Kompetenzen aus InfectControl, um in Frühgeborenen den Einfluss von Mikrobiomveränderungen zu untersuchen, die durch Antibiotikagabe und Nutzung von Probiotika ausgelöst werden.

Ziel war die Entwicklung einer bioinformatischen Pipeline zur standardisierten Analyse von Mikrobiomdaten aus unterschiedlichsten Probenmaterialien. In enger Kooperation zwischen dem Robert-Koch-Institut und dem Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie - Hans-Knöll-Institut - (Leibniz-HKI) wurden neue bioinformatische Methoden zur Datenanalyse entwickelt, die auf Vorarbeiten der Projekte FINAR und IRMRESS basieren.

Einflussfaktoren auf die Zusammensetzung von Mikrobiom (Bakteriom und Mykobiom) und Resistom wurden systematisch analysiert, insbesondere der Einfluss von Antibiotika und Probiotika auf die Darm-Mikrobiota bei Frühgeborenen. Am neonatalen Mausmodell wurd die langfristige Erregerentwicklung nach Antibiotikaapplikation mit und ohne zusätzliche Probiotikagabe untersucht, die Rückschlüsse auf das menschliche Mikrobiom zulässt und damit neben der Analyse von Assoziationen auch eine funktionelle Aufarbeitung der erhobenen Befunde anstrebte. Die parallele Untersuchung von Bakteriom, Mykobiom und Resistom in Mensch und Tier ermöglichte einen Methodenablgeich sowie die Anwendung kompatibler bioinformatischer Methoden der Auswertung der Sequenzanalyse-Daten über verschiedene Mikroorganismen. NeoBIOM diente der Früherkennung von Infektionskrankheiten und -risiken bei Frühgeborenen sowie der Ableitung möglicher Präventions- und Therapieoptionen.